A nomeação da nova administração marca a transição desta unidade de saúde com estatuto de sociedade anónima de capitais exclusivamente públicos, a entidade pública empresarial.

O novo Conselho de Administração para o Centro Hospitalar do Barlavento Algarvio, E. P. E., foi nomeado em conjunto pelo Ministério das Finanças e Ministério da Saúde, a 31 de Dezembro de 2005.

O Conselho de Administração será presidido pelo Dr. Luís Batalau, director de serviço de Pediatria do CHBA e composto pelos seguintes elementos: director clínico, Dr. Luís Contente, assistente graduado de gastrenterologia do CHBA; enfermeira-directora, Enf. Mariana Caeiro, enfermeira chefe do CHBA; vogal, Dr.ª Conceição Saúde, administradora hospitalar do CHBA; vogal, Dr. Paulo Morgado, assistente graduado de clínica geral do Centro de Saúde de Lagos.

A nova administração pretende, para além da gerir o Centro Hospitalar do Barlavento Algarvio, criar condições para a criação da Unidade Local de Saúde do Barlavento Algarvio, que englobará para além daquele Centro Hospitalar, os Centros de Saúde da área de referência daquela unidade de saúde.